Presso il Dipartimento di Scienze Economiche è attivo il seguente corso di Dottorato:
- Economics, interamente in lingua inglese, è un programma della durata di 4 anni interdisciplinare e orientato a livello internazionale, che mira a formare studenti con le competenze più avanzate e aggiornate nel campo dell'economia, preparandoli a svolgere autonomamente ricerche economiche innovative.
Inoltre, il Dipartimento di Scienze Economiche è coinvolto nei seguenti dottorati che hanno una sede amministrativa diversa:
- Health and Longevity - corso di dottorato interamente in lingua inglese, interdipartimentale e in convenzione con l'Istituto Mario Negri. Proponente: dipartimento di Ingegneria Gestionale, dell'Informazione e della Produzione
- Applied Economics and Management (AEM) interamente in inglese, in convenzione con l’Università di Pavia. L’obiettivo formativo è offrire un ampio spettro di competenze, strumentali e specialistiche, nei campi dell’economia e del management in tutte le possibili declinazioni legate alle imprese e ai settori produttivi. Sede amministrativa presso l'Università di Pavia.